欧冠一战成名 2009年3月11日，注定是穆勒值得纪念的一天，拜仁在这一天和来访的里斯本竞技进行欧冠八分之一决赛第二回合比赛，首回合50的比分让晋级资格已经失去了悬念，但拜仁依旧在主场71横扫对手，穆勒也迎来了自己的欧冠处子秀，他在最后时刻替补登场，结果很快便打入拜仁的最后一球，为球队锁定胜局对一名新星而言；接下来的两个赛季，拜仁实现了德甲冠军“帽子戏法”，但达到巅峰的胜利是在1974年欧洲冠军杯决赛，拜仁在重赛中以40横扫马德里竞技，首度加冕欧洲冠军杯冠军球队在随后几年于国内联赛中并不顺利，却在欧冠赛场上捍卫了自己的欧洲冠军地位1975年的欧冠决赛中，拜仁凭借弗朗茨·罗特和盖德·穆勒在比赛末段的两粒进球战胜；上半场比赛拜仁完全掌握优势，蒂亚戈头球首开纪录，博阿滕的头球得分之后莱万多夫斯基梅开二度，穆勒也打进一记运气球下半场比赛波尔图扳回一城，但是阿隆索的直接任意球彻底熄灭对方的希望最终拜仁主场61击败对手，总比分74逆转，连续第四个赛季晋级欧冠半决赛阶段北京；不是，是尤普·海因克斯，并且是海帅第三次执教拜仁前巴塞罗那主教练何塞普·瓜迪奥拉于201314赛季开始接掌拜仁成为主教练201213赛季，拜仁先是在德国超级杯中以21战胜多特蒙德，其后拜仁在客场以50战胜杜塞尔多夫后，成为了德甲历史上首支取得开赛8连胜的球队2013年4月6日，拜仁又在联赛还剩。

其次，拜仁慕尼黑的球员个人能力出众，也是他们能够轻松取胜的重要原因例如，前锋莱万多夫斯基在比赛中打入两球，展现了他出色的得分能力中场球员穆勒和蒂亚戈也贡献了精彩的传球和控球表现，为球队的胜利立下了汗马功劳这些球员的出色表现，使得拜仁在场上始终保持着压制性的优势最后，拜仁慕尼黑之所以能够在这场比赛中取得胜利，也与他们；2020年8月14日晚，欧冠14决赛在里斯本的阿尔马达球场进行，巴萨对阵拜仁这场比赛被誉为欧冠历史上最惨烈的淘汰赛之一，最终巴萨以2比8的惨痛比分被淘汰出局比赛开始后，巴萨便陷入了被动第4分钟，拜仁就由穆勒打破了僵局，巴萨防线出现了漏洞第21分钟，拜仁再次进球，比分变成了2比0巴萨在；北京时间2015年5月13日星期三凌晨2点45分，德甲巨人拜仁慕尼黑在主场安联球场迎来巴塞罗那的挑战，展开欧冠半决赛第二回合的较量上半场比赛拜仁凭借贝纳蒂亚的头球破门率先打破僵局，但是内马尔连续两次接苏亚雷斯妙传破门反超比分，上半场结束巴萨21领先拜仁下半场比赛拜仁气势如虹，莱万扳平了比分，穆勒的；在常规的90分钟比赛时间里，双方你来我往，战得难解难分拜仁凭借穆勒和罗本的进球，以2比1的比分领先然而，皇马并未放弃，他们在比赛的最后时刻由C罗扳回一球，将比分追至2比2平，将比赛拖入加时赛加时赛中，双方的对抗更加激烈，球员们的体力已经接近极限然而，皇马凭借着C罗和拉莫斯的进球；在里斯本的光明球场进行的2022年9月15日凌晨，2022至2023赛季欧洲冠军联赛八分之一决赛继续在里斯本的光明球场进行，西甲豪门巴塞罗那与德甲冠军拜仁慕尼黑相遇在这场激烈的对决中，穆勒和库蒂尼奥表现出色，各自贡献两球一助攻，帮助拜仁以82的比分战胜巴萨凭借这场胜利，拜仁以全胜的战绩成功晋级四强；此外，拜仁还拥有丰富的欧冠经验自2013年以来，拜仁已经连续8次进入欧冠半决赛，并且有5次成功晋级决赛其中，拜仁在20192020赛季成功捧起大耳朵杯，成就了俱乐部历史上的又一座辉煌今年的欧冠半决赛，拜仁将在安联球场迎接挑战无论是对阵哪支球队，拜仁都将以高昂的斗志和出色的团队配合迎接对手；201314赛季德甲联赛中，穆勒出场29次，打进13粒进球，贡献10次助攻，帮助拜仁慕尼黑卫冕德甲冠军 在欧冠联赛中，穆勒出场12次，打进5粒进球，贡献1次助攻，却依然无法阻止拜仁慕尼黑在欧冠半决赛两回合05惨败给本届欧冠冠军皇家马德里 在德国杯中，穆勒出场6次，打进8球，帮助拜仁慕尼黑夺取德国杯冠军，并夺取德国杯。

与皇马的欧冠半决赛前最后一战，拜仁3球轻取汉诺维，传射建功的穆勒自然是最大的亮点相比起进球，状态正佳的穆勒，实现了两个成就个人单赛季联赛助攻最多，同时登顶德甲助攻榜众所周知，虽然穆勒真正获得全球级声望，靠的是在世界杯上不断的摧城拔寨但实际上，多年来的穆勒，并不是一个赛季能；前奏巴萨赛季表现不佳 在本赛季，巴塞罗那队在西班牙甲级联赛中的表现并不理想，最终仅获得亚军在欧冠小组赛中，他们同样只以小组第二的身份出线在18决赛中，巴萨与拜仁慕尼黑相遇，并以4比2的比分惊险晋级上半场拜仁掌控比赛 比赛伊始，拜仁便掌控了比赛的节奏开场仅4分钟，穆勒便通过头球；北京时间2016年4月14日2时45分葡萄牙当地时间13日19时45分，欧冠14决赛次回合又赛2场，拜仁客场2比2平本菲卡，总比分3比2晋级4强劳尔希门尼斯头球首开纪录，比达尔世界波扳平下半时，穆勒反超比分，本赛季欧冠8球仅次于C罗，将德国球员冠军杯进球纪录改写为36球科斯塔中柱本菲卡替补塔利斯卡任。

201213赛季欧洲冠军联赛半决赛首回合拜仁慕尼黑主场较40大胜巴塞罗那次回合拜仁客场挑战巴萨，罗本和穆勒建功，加上皮克的乌龙球，拜仁30客场再胜，总比分70晋级决赛2013年5月25日欧洲冠军联赛决赛凭借罗本与曼朱基齐的进球拜仁慕尼黑队21战胜德甲劲旅多特蒙德队第五次称霸欧洲2013年6月1日德国；点球战中，诺伊尔前2轮扑出C罗和卡卡点球，卡西利亚斯随后也封出克罗斯和拉姆点球拉莫斯打飞，施魏因斯泰格射进决定性的一球首回合皇马客场1比2告负，但近11个欧冠主场取胜10场两队此前两次欧冠半决赛交锋，晋级球队都最终夺冠2001年拜仁2000年皇马拜仁是欧冠中击败皇马次数最多的球队8次。